Ci sono 3 tipi di missioni.
Le principali sono quelle che nel ramo obiettivi si trovano al centro (lega) sotto (i 12 tizi) e quelle su Naoe/Yasuke (nel mezzo delle due precedenti). Poi hai le "storie di -nome zona-" che hanno all'interno sia normali missioni sia fetch quest (una per zona).
Di solito la maggior parte di queste fa apparire altri cerchi nel ramo obiettivi con gli obiettivi di uccisione. Cerchi che possono apparire anche prima di incontrare gli NPC della missione se li becchi e uccidi qualcuno in giro.
Le missioni "importanti" le trovi di solito anche nei "rombi" come icone sulla mappa, una a zona, a volte due. Lì appaiono NPC importanti spesso e volentieri. Ed anche alcune cutscene con Naoe e Yasuke che si "raccontano" per così dire