3 Novembre 2552
Dopo aver eliminato Sesa 'Refumee, distrutto la fazione degli eretici e annientato sul nascere la diffusione di alcune spore flood rilasciate durante gli scontri, l'Arbiter fu inviato sull'Installazione 05 per recuperare l'indice, mentre Master Chief, sbarcato anch'egli sull'installazione, si occupò di eliminare personalmente il profeta del rimorso. Sulla terra invece, l'ODST noto unicamente come "La Recluta", si risvegliò in un'evacuata e occupata New Mombasa, dove i Brute hanno sterminato i loro capi Sangheili e saccheggiato la città, e partì alla ricerca della sua squadra Alpha-Nine, compiendo infine una piccola ma comunque significativa operazione che portò alla cattura di "Quick", un Huragok che possedeva informazioni strategiche vitali sui covenat e sulle loro intenzioni verso New Mombasa. In ogni caso, sia l'Arbiter che Master Chief sull'Installazione 05 riuscirono a compiere i loro obiettivi, perdendo però entrambi la coscienza: l'Arbiter fu infatti tradito da Tartarus, il capo supremo di tutti i Brute, per ordine del Profeta della verità, mentre Master Chief, una volta ucciso il profeta del Rimorso, fu costretto a gettarsi in un lago per evitare il bombardamento di un vascello Covenat.
I Profeti dunque, delusi dalla morte di un gerarca, dalla perdita di un'installazione e dalla distruzione di gran parte della flotta Covenat, diedero il via al Grande Scisma: Tutti i Sangheili furono ufficialmente declassati e sostituiti con i Brute, scatenando una colossale guerra civile attorno e dentro Alta Opera con [se non mi sbaglio ndr] i Grunt e i Cacciatori dalla parte degli Elite, i Profeti e i Jackal dalla parte dei Brute; ma i problemi non finirono qui. Come detto in uno dei primi post, i Flood si erano diffusi all'interno dell'Installazione 05 nonostante gli sforzi del monitor 2401 Penitent Tangent di frenare l'infestazione; l'accumularsi di menti e corpi per oltre un centinaio di migliaia di anni portò alla formazione della Mente Suprema, che decise di salvare sia l'Arbiter che Master Chief e convincerli che se l'anello fosse stato attivato sia gli Umani che i Covenat che i Flood sarebbero stati spazzati via. Nacque quindi una prima improbabile alleanza, con l'Elite inviato per liberare i suoi fratelli prigionieri e fermare l'attivazione dell'anello, e lo Spartan teletrasportato su Alta Opera, per evitare che il Profeta della Verità potesse fuggire sulla Terra.
In questo caos più totale, il parassita si diffuse comunque sulla capitale Covenat, infestando e uccidendo miliardi di esseri viventi, mentre tutta la flotta Covenat rimasta fedele ai Profeti si diresse verso la terra. Alla fine, l'Arbiter riuscì nel suo scopo, eliminando Tartarus e firmando una tregua con gli umani, mentre Master Chief raggiunse il profeta della verità a bordo del misterioso vascello dei Forerunner al centro di Alta Opera, ma fu scaraventato via poco prima di raggiungere la terra.
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Comunque IMHO, Halo 2 ha la miglior storia intesa come narrativa e ambientazioni, quanto cazzo sono fighi i Sangheili